天津新增的第137例病例全基因组测序结果是怎样的?
年6月22日从天津市疾控中心获悉,经天津市疾控中心对本市第137例确诊病例呼吸道标本的新冠病毒全基因组高通量测序和序列分析,中国疾控中心复核 ,确认与北京新发地市场相关病例的病毒序列完全相同,属于L基因型欧洲家系分支I。
月17日,天津市新增1例本土新冠肺炎确诊病例 ,为天津的第137例确诊患者 。但奇怪的是,患者未出天津,未接触确诊者 ,无疑似病例和确诊病例接触史。
信息分析:对测序数据进行生物信息分析,包括数据质量控制、变异检测 、基因注释等,最终得到全基因组的测序结果。生物信息分析项目WGS的生物信息分析项目通常包括以下几个方面:变异检测:检测单核苷酸变异(SNV)、插入和缺失(indel)、拷贝数变异(CNV)和结构变异(SV)等 。
高测序深度:可以提高数据的准确性和可信度 ,减少测序误差和偏差,有助于发现低频突变或变异,提高复杂基因组区域的解析能力。低测序深度:可能导致某些区域的覆盖度不足 ,出现“低覆盖度区域”,从而影响测序结果的准确性和完整性。